1805 En la costa andaluza, frente a la localidad de Barbate – España muere durante la Batalla de Trafalgar en la nave Victoria, víctima del disparo de un francotirador francés, el Vicealmirante británico Horatio Nelson.
«Por fin han acabado conmigo»
«me han atravesado la columna vertebral»
Durante el sitio de Calvi fue herido en el ojo derecho, del que finalmente perdió la visión. Fue comodoro en 1796 y al año siguiente, tuvo una destacada intervención en la batalla frente a las costas del cabo de San Vicente (Portugal) que concluyó con la victoria de la flota británica, capitaneada por John Jervis sobre una flota española, aliada con Francia. En julio de 1797 al mando de una flota de pequeñas embarcaciones dirigió un ataque a Santa Cruz de Tenerife, en las islas Canarias; fracasó y fue herido en el brazo derecho, que hubo de amputársele más tarde.
Fue nombrado duque de Bronte (1800) por Fernando I de Borbón, rey de las Dos Sicilias, en reconocimiento por sus servicios. Regresó a Gran Bretaña y se separó de su esposa al año siguiente. Fue vicealmirante en 1801 y a las órdenes del almirante Parker cuando éste recibió el mando de la flota enviada al mar Báltico para obligar a Dinamarca y Suecia a interrumpir su ayuda económica a Francia. Aunque era el segundo de a bordo, se hizo cargo de las operaciones y destruyó la flota danesa. Es nombrado vizconde pocos meses después.
Se le asignó el mando de la flota británica del Mediterráneo. Bloqueó Tolón, en donde se encontraban numerosas naves francesas, dirigidas por el vicealmirante Pierre Charles de Villeneuve, preparadas para invadir las islas Británicas. Retuvo a los franceses durante dos años, pero lograron escapar en 1805 y se dirigieron hacia las Antillas. Inició la persecución, pero el enemigo consiguió evitarle y regresar a Europa.
Los franceses se refugiaron en Cádiz, donde se les unieron varios navíos españoles. Los británicos bloquearon la ciudad, pero Villeneuve consiguió salir del puerto y plantar batalla frente a las costas del cabo de Trafalgar (entre Cádiz y Tarifa, en España). Aniquiló a la flota francesa y española en la batalla del 21 de octubre de 1805, dirigiendo él mismo el ataque desde el buque insignia Victory; en la batalla fue herido de muerte falleciendo poco después.